Диагностика методом ПЦР: современный подход выявления инфекционных и генетических заболеваний
Все чаще в современной медицине можно услышать о ПЦР-диагностике, или полимеразной цепной реакции. Эта услуга может показаться сложной и непонятной для большинства пациентов, но на самом деле это современный метод постановки диагнозов, связанных с инфекционными и вирусными заболеваниями. В этой статье мы расскажем, как работает ПЦР-метод, какие преимущества он имеет и какие этапы включаются в процесс его проведения.
Полимеразная цепная реакция (ПЦР) - это сложный биохимический процесс, который позволяет умножать исходный ДНК-образец множество раз. Этот метод основывается на использовании фермента, который осуществляет копирование ДНК-цепей. Копирование проходит в специальных пробирках, обеспечивающих оптимальные условия для реакции, которую можно наблюдать в виде ее усиления.
Одно из преимуществ ПЦР-метода заключается в том, что он может обнаруживать вирусы и бактерии, которые не видны при обычном исследовании. Этот метод также позволяет определить наличие этих инфекций в тканях и жидкостях пациента.
Чтобы провести ПЦР-диагностику, необходимо взять материал для исследования — кровь, мочу, слюну или другие биологические жидкости. Затем проводится этап подготовки образца для реакции, после чего он помещается в аппарат для дальнейшей обработки.
Итак, ПЦР-метод является современной и перспективной технологией в диагностике инфекционных и вирусных заболеваний, которая использует определенные этапы и подходы для максимального качества анализа. Если вам требуется постановка диагноза в таком случае, не стесняйтесь обратиться к данному методу.
ПЦР-диагностика: принцип работы и возможности
Существующий чуть более 30 лет, метод диагностики инфекций с помощью ПЦР (полимеразной цепной реакции) эволюционировал значительно и стал одним из наиболее точных и широко используемых способов выявления патогенных микроорганизмов.
Основой ПЦР является многократное увеличение концентрации фрагментов ДНК возбудителя в биологической пробе пациента в искусственных условиях. В результате сложного процесса, называемого амплификацией, под воздействием ферментов и изменения температуры (от 50 до 95°С) из одной молекулы ДНК образуется две. Этот процесс делает возможным копирование участка ДНК, который существует только у того вида патогенного микроорганизма, который интересует врача.
За несколько минут и несколько десятков циклов амплификации можно получить количество молекул, достаточное для дальнейшего анализа. Кроме того, с помощью ПЦР можно проводить и другие манипуляции с генетическим материалом, например, сращивать фрагменты ДНК, вводить мутации и т.д. Это делает ПЦР полезным не только для диагностики инфекционных и генетических заболеваний, но и для установления отцовства, клонирования и выделения новых генов.
Проведение ПЦР-диагностики требует специального оборудования и производится в специальных лабораториях. На сегодняшний день существует множество различных модификаций метода, включая технологии с использованием кислоты РНК. В некоторых из них амплификация осуществляется при постоянной температуре и для их проведения не требуется специальное оборудование.
Популярным среди различных модификаций является "горячий старт ПЦР", который предварительно прогревает пробирки с амплификационной смесью при температуре 95°С в течение 3–5 минут для предотвращения клонирования неспецифических фрагментов ДНК.
Еще одной популярной модификацией является мультиплексная амплификация (МПА), которая позволяет проводить исследование нескольких фрагментов в одной пробирке. Это позволяет сократить время и затраты на проведение анализа и повысить точность исследования методом ПЦР.
Одним из наиболее востребованных методов анализа в клинической медицине является ПЦР-диагностика. Этот метод находит применение в самых различных сферах.
В области урогинекологии ПЦР-диагностика используется для выявления половых инфекций, характеризующихся слабой выраженностью симптомов и часто вызывающих бесплодие и невынашивание беременности у женщин. При помощи ПЦР можно выявить наличие целого «букета» инфекций, включая хламидиоз, несколько видов микоплазмы, уреаплазму, трихомониаз, гарднереллу, кандиду, гонококк и трепонему. Кроме этого, времянка и точность ПЦР-диагностики позволяют выявить генитальный герпес и вирус папилломы человека, предотвращая риск развития злокачественных заболеваний шейки матки у женщин.
В неонатологии ПЦР-диагностика эффективно выявляет наличие неонатальных инфекций у плода уже в утробе матери и у новорожденных. Среди опасных заболеваний отмечаются цитомегаловирус, токсоплазмоз, вирусы краснухи и герпеса, хламидии и микоплазмы.
Пациентам, инфицированным опасными заболеваниями крови или плазмы, такими как ВИЧ, сифилис, гепатиты, также требуется ПЦР-диагностика для избежания риска переливания крови. Метод ПЦР значительно превосходит по точности серологические методы, позволяя выявлять даже инфекции, имеющие длительный инкубационный период, которые не могут быть обнаружены обычными исследованиями в первые несколько недель.
В клинике инфекционных заболеваний ПЦР-диагностика применяется для выявления различных инфекций, включая вирусы гепатита, СПИД, холеры, бруцеллеза, туляремии, дифтерии и токсоплазмоза.
В фтизиатрии и пульмонологии ПЦР-диагностика является неоценимым инструментом для выявления возбудителей атипичных форм пневмонии и хронических рецидивирующих бронхитов, таких как хламидии и микоплазмы. Этот метод также позволяет проводить видовую идентификацию возбудителя и своевременно поставить диагноз туберкулеза.
Помимо клинической медицины, ПЦР-диагностика находит применение в криминалистике, экспериментальной медицине, создании генетических паспортов, мониторинге состояния окружающей среды, анализе продуктов питания, фармакологии и ветеринарии.
Оценить наличие возбудителя инфекции в организме иногда не так просто. Именно поэтому ПЦР-диагностика получила такое широкое распространение в медицинской практике. Она является более точным и надежным методом, чем многие другие аналитические способы, и имеет ряд явных преимуществ:
С помощью ПЦР-метода можно непосредственно определить наличие возбудителя инфекции. К примеру, иммуноферментный анализ (ИФА) выделяет только белки-маркеры, которые являются побочным продуктом жизнедеятельности микроорганизмов, и поэтому указывает на наличие инфекции косвенно. С другой стороны, ПЦР-анализ выявляет специфические участки в ДНК и с большой точностью указывает на присутствие конкретной инфекции.
Высокая специфичность ПЦР-диагностики обусловлена тем, что в исследуемом материале выявляются лишь фрагменты ДНК, которые характерны только для определенных возбудителей инфекции. Это исключает вероятность ложных результатов анализа, чего неизбежно можно заблюдать в иммунологических методах, где ошибки возникают из-за перекрестной реакции антигенов.
ПЦР-диагностика также отличается от многих других методов высокой чувствительностью. Она позволяет выявить наличие даже единичных клеток вирусов или бактерий в таких случаях, когда обычными методами сделать это практически невозможно. Например, ПЦР позволяет выявлять всего 10-100 клеток в пробе, в то время как при использовании иммунологических и микроскопических тестов для определения инфекции необходимо иметь не менее 103-105 клеток.
Применение универсальных методов лабораторных исследований, которые диагностируют сразу несколько возбудителей из одной биологической пробы, является еще одним плюсом ПЦР-диагностики. Этот метод может применяться для выявления возбудителей инфекции не только в организме человека, но и в почве, воде, продуктах питания и других материалах.
Скорость получения результатов является еще одним преимуществом ПЦР-диагностики. Поскольку для проведения анализа не нужно производить посев и выделение культуры возбудителя, то и большого количества времени не требуется. Весь цикл от забора биоматериала до получения результатов занимает всего 4-5 часов.
В заключение, метод ПЦР-диагностики известен своей способностью диагностировать трудно культивируемые и некультивируемые формы микроорганизмов, которые могут вызывать скрытые инфекции.
Метод ПЦР-диагностики, несмотря на свою популярность и эффективность, обладает рядом ограничений. Однако, количество этих ограничений настолько незначительно, что не препятствует использованию метода.
Возможно не только амплификация ДНК живых микроорганизмов, но и погибших. Используя ПЦР-диагностику для контроля эффективности лечения, необходимо соблюдать определенные правила. В первую очередь, проводить анализ нужно после определенного промежутка времени (1-2 месяца), за который происходит полное исчезновение возбудителя инфекции из организма.
Существует возможность возникновения перекрестной реакции. Подбор фрагментов ДНК (праймеров) основывается на генетическом строении конкретного микроорганизма. Теоретически, такой же фрагмент может присутствовать и у других микроорганизмов, геном которых на сегодняшний день еще не расшифрован, что может привести к ложноположительному результату анализа.
Также, изменчивость микроорганизмов может создать проблемы в процессе ПЦР-анализа. Эта способность возбудителей к мутации порой приводит к неуловимости некоторых штаммов в процессе анализа.
Однако, для уменьшения рисков, были разработаны стандарты объемов испытаний тест-систем ПЦР-диагностики, включающие проверку на перекрестные реакции и тестирование всех известных штаммов конкретного возбудителя.
Метод ПЦР является одним из самых точных для выявления микроорганизмов в биоматериале. Весь процесс диагностики проводится в специальной лаборатории и состоит из нескольких этапов.
Первый этап - забор биоматериала. Это происходит в процедурном кабинете соответствующего профиля. Для исследования используются эпителиальные соскобы со слизистых оболочек, моча, мокрота, кровь, биологические жидкости и биоптаты. При этом необходимо соблюдать правила стерильности и избегать попадания следов крови в материал.
Второй этап - хранение и транспортировка биоматериала. Образцы хранятся при комнатной температуре не более 2 часов. Для длительного хранения пробы помещают в холодильник с температурой 2–8°С на срок не более одних суток или в замороженном виде при температуре -20°С. При транспортировке биоматериала необходимо соблюдать все правила, используя специальные термоконтейнеры или термосы.
Третий этап - выделение ДНК из образца. Для каждого вида образца используется свой метод выделения. Например, для анализа соска эпителиальных клеток используется метод твердофазной сорбции.
Четвертый этап - проведение ПЦР. Некоторое количество образца из биологической пробы переносится в специальную микроцентрифужную пробирку, где проводится амплификация микроорганизмов. Одновременно проводятся контрольные пробы.
Пятый этап - регистрация результатов. Фрагмент ДНК, характерный для возбудителя инфекции, выделяют методом электрофореза в присутствии специального вещества. Образец просматривают в ультрафиолетовом свете — наличие светящейся полосы свидетельствует о положительном результате.
Шестой этап - интерпретация результатов исследования. Результаты могут быть положительными или отрицательными. На основании количественного результата можно оценить степень активности заболевания и определить характер лечения.
Стоимость ПЦР-диагностики: Что влияет на цену?
Цена на ПЦР-диагностику может очень сильно варьироваться и зависит от нескольких факторов. Как отмечается в статье, стоимость анализа зависит от конкретной инфекции, на которую пациент планирует проверяться, а также от вида анализируемого материала и методики тестирования - качественной или количественной. В разных медицинских клиниках цена за определение одной инфекции может варьироваться от 200 до 800 рублей.
Но это не все затраты, связанные с проведением ПЦР-диагностики. К стоимости анализа добавится оплата за забор биоматериала, которая составляет около 400 рублей. Примерные цены на анализы ПЦР в Москве приведены в таблице 1, где указаны цены на определение ДНК и РНК различных инфекций и вирусов.
Кроме того, многие медицинские центры предлагают провести ПЦР-исследование комплексно, включая несколько анализов в одном пакете услуг. Например, «ПЦР-8», который включает в себя восемь бактериальных и вирусных возбудителей острых кишечных инфекций, обойдется в 1400 рублей, а «ПЦР-12», включающий 12 половых инфекций, - в 3500 рублей. Комплексное проведение анализов позволяет существенно сэкономить деньги, поскольку отдельное прохождение ПЦР-диагностики для каждой инфекции будет гораздо дороже.
Фото: freepik.com